نوع مقاله : مقاله پژوهشی کامل
نویسندگان
بخش شیمی، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران
چکیده
ویروس موزاییک تنباکو، زیان اقتصادی زیادی به تنباکو، فلفل، خیار و گل‌های زینتی در سراسر جهان وارد می‌نماید. در این مطالعه، یک سری از مشتقات جدید اکینوپسین حاوی اسیل هیدرازون با فعالیت انتی ویروسی بر علیه ویروس موزاییک تنباکو (TMV) با استفاده از محاسبات رابطه فعالیت کمیت-ساختار و اتصال مولکولی مورد بررسی قرارگرفت. آنالیز اتصال مولکولی مشتقات اکینوپسین با پروتئین ویروس موزائیک توتون (2OM3)با استفاده از نرم افزار اتوداک انجام شد و توصیفکننده هایی مانند انرژی اتصال، انرژی الکترواستاتیک و انرژی پیوند هیدروژنی محاسبه گردید. مقادیر منفی انرژی اتصال نشان داد که ماهیت اتصال این مشتقات، به عنوان لیگاند با پروتئین 2OM3قوی است. برای مدل QSAR، ابتدا مجموعه داده به دو گروه آموزش و مجموعه تست تقسیم شد. سپس توصیفگرها با استفاده از مکانیک کوانتومی، اتصال مولکولی و توصیفگرهای مولکولی محاسبه شدند. سپس مدلسازی به روش رگرسیون خطی چندگانه (MLR) انجام شد. مشخص شد که انرژی کمترین اوربیتال مولکولی اشغال نشده (LUMO) و تغییرات انرژی آزاد گیبس در مدل نقش دارند. همچنین توصیفگرهای داکینگ مولکولی مانند توصیفگرهای انرژی کل برهمکنش‌های واندروالس، پیوند هیدروژنی و انرژی مجموع واندوالس، هیدروژنی و حل‌شوندگی در مدل رگرسیونی تأثیر دارند. این مطالعه می‌تواند نقش مهمی در طراحی مهارکننده‌های ضد ویروس TMV داشته باشد.
کلیدواژه‌ها
)