نوع مقاله : مقاله پژوهشی کامل
نویسندگان
گروه شیمی، دانشکده علوم، دانشگاه پیام نور، تهران، ایران
چکیده
یک مدل کمی رابطه ساختار-فعالیت (QSAR) برای پیشبینی فعالیت ضد میکروبی مشتقات 2، 4، 6-s-تری آزین به عنوان عامل‌های ضد مالاریا استفاده شد. فعالیت ضد میکروبی 22 مشتقات 2، 4، 6-s-تریازین با توصیفگرهای محاسبات شیمیایی کوانتومی با روش نظریه تابعیت چگالی (DFT) در سطح B3LYP/6-31G و توصیفگرهای توپولوژیکی مدل‌سازی شد. این مطالعه با استفاده از رگرسیون خطی چندگانه (MLR)، تحلیل حداقل مربعات جزئی (PLS) و روش رگرسیون مؤلفه اصلی (PCR) انجام شد. نتایج نشان داد که روش MLR فعالیت ضد میکروبی را به اندازه کافی خوب پیشبینی میکند. بهترین مدل با شش توصیفگر انتخاب شد. همچنین نشان‌دهنده سازگاری بسیار خوبی با تغییرات داده‌ها برای روش‌های اعتبارسنجی است. مقادیر پیش‌بینی‌شده فعالیت ضد میکروبی مطابقت مناسبی با نتایج تجربی دارد. نتایج به‌دست‌آمده نشان می‌دهد که روش PLS می‌تواند برای پیشبینی فعالیت ضد میکروبی مشتقات 2، 4، 6 -s تری آزین مفیدتر باشد. این مطالعه برای پیشبینی فعالیت سایر مشتقات این در گروه قابل استفاده میباشد.
کلیدواژه‌ها
- Blasco, D. Leroy, D.A. Fidock, Antimalarial drug resistance: linking Plasmodium falciparum parasite biology to the clinic, Nat. Med. 23 (8) (2017) 917–928.
- J. Modest, Chemical and biological studies on 1, 2-dihydro-s-triazines. II. Three-component synthesis, J. Org. Chem. 21 (1956) 1–13.
- Klenke, M.P. Barrett,R. Brun, I.H. Gilbert, Antiplasmodial activity of a Series of 1, 3, 5-triazine-substituted polyamines, J. Antimicrob Chemother. 52 (2003) 290–293.
- Garwal, K. Srivastava, S.K. Puri, P.M.S. Chauhan, Synthesis of 2, 4, 6-trisubstituted triazine as antimalarial agents, Bioorg. Med. Chem. Lett. 15 (2005) 531–533.
- N. Yakhontov, G.M. Vakhatova, Search for medicinal preparations in the series of 1, 3, 5-triazines, Pharm. Chem. J. 15 (1981) 546–561.
- M.S. Chauhan, Currents and potential flaricides, Drugs Future. 25 (2000) 481–488.
- M.S. Chauhan, S.K. Srivastava, Present trends and future strategy in chemotherapy of malaria, Curr. Med. Chem. 8(2001) 1535–1542.
- L. Blakley, S.J. Benkovic, Dihydrofolate reductase in folates and pteridines. Chemistry and biochemistry of folates: dihydrofolate reductase, vol 1. Wiley, New York (1984) 191–251.
- Yousefnejad, M. Mahboubifar, R. Eskandari, Quantitative structure-activity relationship to predict the anti-malarial activity in a set of new imidazolopiperazines based on artifcial neural networks, Malaria J. 18 (310) (2019) 1-17.
- Hadni, M. Elhallaoui, 2D and 3D-QSAR, molecular docking and ADMET properties in silico studies of azaaurones as antimalarial agents, New J. Chem. 44 (2020) 6553–6565.
- H. Masand , A.A. Toropov, A.P. Toropova, D.T. Mahajan, QSAR models for anti-malarial activity of 4-aminoquinolines, Curr. Comput. Aided Drug Des. 10 (1) (2014) 75-82.
- Sanchait, H. Iftikar, K.H. Kalyan, S. Pubalee, C.D. Ramesh, Quantitative Structure-Activity Relationships of the Antimalarial Agent Artemisinin and Some of its Derivatives – A DFT Approach, Comb. Chem. High T. Scr. 16 (8) (2013) 590-602.
- T.V. Nguyen, T. V. Dat, S. Mizukami, D. L. H. Nguyen, F. Mosaddeque, S. N. Kim, D. H. B. Nguyen, O. T. Đinh, T. L.Vo, G. L.T. Nguyen, C. Q. Duong, S. Mizuta, D. N. H. Tam, M. P. Truong, N. T. Huy, K. Hirayama, 2D-quantitative structure–activity relationships model using PLS method for anti-malarial activities of anti-haemozoin compounds, Malaria J.20 (64) (2021)1-12.
- Pathak, H. Ojha, A.K. Tiwari, D. Sharma, M.Saini, R. Kakkar, Design, synthesis and biological evaluation of antimalarial activity of new derivatives of 2,4,6-s-triazine, Chem. Cen. J. 11 (2017) 132-143.
- J. Frisch, et al. Gaussian 09, Revision B,01, Gaussian, Inc, Pittsburgh, PA. 2009.
- G.Parr, R.G.Pearson, Absolute hardness: companion parameter to absolute electronegativity, J. Am. Chem. Soc. 105(1983) 7512-7516.
- Lee, W.Yang, R.G. Parr, Development of the Colle-Salvetti correlation energy formula into a functional of the electron density, Phys. Rev. B 37 (1988) 785-789.
- Mauri, V. Consonni, M. Pavan, R. Todeschini, Dragon software: an easy approach to molecular descriptor calculations, MATCH Commun. Math. Comput. Chem. 56 (2006) 237–248.
- Todeschini, V. Consonni, Handbook of Molecular Descriptors, Wiley-VCH, Weinheim (2000) pp. 667-690.
- Consonni, D. Ballabioand, R. Todeschini, Comments on the definition of the Q2 parameter for QSAR validation, J. Chem. Inf. Model 49 (2009) 1669-1678.
- Consonni, D. Ballabioand,R. Todeschini, Evaluation of model predictive ability by external validation techniques, J. Chemometrics 24 (2010)194-201.
- Y. Lee, C.Y. Chen, Toxicity and quantitative structure–activity relationships of benzoic acids to Pseudokirchneriella subcapitata, J. Hazard. Mater. 165 (2009) 156-161.
- Jing, Z. Zhou, J. Zhuo, Quantitative structure-activity relationship (QSAR) study of toxicity of quaternary ammonium compounds on Chlorella pyrenoidosa and Scenedesmus quadricauda, Chemosphere 86 (2012) 76-82.
- Wold S, M. Sjostrom, L. Eriksson, PLS-regression: a basic tool of chemometrics. Chemomet Intell Lab. 58 (2001) 109–130.
- Saghaie, H. Sakhi, H. Sabzyan, M.Shahlaei, D. Shamshirian, Stepwise MLR and PCR QSAR study of the pharmaceutical activities of antimalarial 3-hydroxypyridinone agents using B3LYP/6-311++G** descriptors. Med. Chem. Res. 22 (2013) 1679–1688.
)