نصرت مددی ماهانی
چکیده
برهمکنشهای پروتئین 6twk با داروی اکتوئین، مزدوج اکتوئین- دندریمر پلیامیدوامین و مزدوج اکتوئین- دندریمر پلی امیدوامین اصلاحشده با هیستیدین با استفاده از داکینگ مولکولی شبیهسازی دینامیک مولکولی بررسی گردید. بر اساس نتایح داکینگ مولکولی، افزایش انرژی پیوندی و کاهش ثابت بازداری ترکیبات، فعالیت بازداری آنها افزایش می یابد. ...
بیشتر
برهمکنشهای پروتئین 6twk با داروی اکتوئین، مزدوج اکتوئین- دندریمر پلیامیدوامین و مزدوج اکتوئین- دندریمر پلی امیدوامین اصلاحشده با هیستیدین با استفاده از داکینگ مولکولی شبیهسازی دینامیک مولکولی بررسی گردید. بر اساس نتایح داکینگ مولکولی، افزایش انرژی پیوندی و کاهش ثابت بازداری ترکیبات، فعالیت بازداری آنها افزایش می یابد. پایداری پروتئین در کمپلکس با این لیگاندها با استفاده از شبیهسازی دینامیک مولکولی مطالعه گردید. نتایج شبیهسازی دینامیک مولکولی نشان داد که کمپلکس پروتئین با دندریمر پلیمری اصلاح شده با هیستیدین- اکتوئین، کمترین مقدار میانگین مربع جابجایی، مناسبترین لیگاند برای پروتئین و جابجایی دارو میباشد و این باعث میشود که نفوذ و کنترل دارو بهتر انجام میشود. همچنین این سیستم میتواند برای بررسی بیشتر بر روی برهم کنشهای دارو اکتوئین و پروتئین معرفی گردد.
نصرت مدی ماهانی؛ خدیجه انجم شعاع؛ سید ضیا محمدی
چکیده
مشتقات N سالیسیلول تریپتامین بهعنوان عامل های ضدحساسیت عصبی دارای پتانسیل درمانی بیماری های الزایمر و پارکینسون میباشند. روشهای محاسباتی روابط کمی خواص- ساختار(QSPR) و شبیهسازی دینامیک مولکولی برای طراحی چهار ترکیب جدید مشتقات N سالیسیلول تریپتامین بصورت موفقیتآمیز استفاده گردید. مدل QSPR پنج متغیره برای پیشبینی خواص ...
بیشتر
مشتقات N سالیسیلول تریپتامین بهعنوان عامل های ضدحساسیت عصبی دارای پتانسیل درمانی بیماری های الزایمر و پارکینسون میباشند. روشهای محاسباتی روابط کمی خواص- ساختار(QSPR) و شبیهسازی دینامیک مولکولی برای طراحی چهار ترکیب جدید مشتقات N سالیسیلول تریپتامین بصورت موفقیتآمیز استفاده گردید. مدل QSPR پنج متغیره برای پیشبینی خواص و فعالیت ضد التهاب عصب مشتقات N سالیسیلول تریپتامین ارائه گردید. توصیفگرهای کوانتومی مانند، انرژی هارتری فاک، انرژی یونش، ممان دوقطبی و انرژی گرمایی با استفاده از روش نظریه تابعیت چگالی در سطح B3LYP/6-311G محاسبه گردید. اعتبارسنجی متقابل رگرسیون خطی چند متغیره MLR برای طراحی مدل QSPR استفاده گردید. مدل دارای بالاترین ضریب همبستگی R2 برابر 900/0برای سری آموزش و 817/0 برای سری تست میباشد. نتایج آماری سازگاری داخلی و خارجی بالایی را بوسیله روشهای اعتبار سنجی نشان میدهد. سه مورد از ترکیبات طراحی شده، خواص دارویی خوبی را با مدل QSPR ارائه میدهند و میتواند راهنمای مناسبی برای کشف و طراحی ترکیبات جدید با خاصیت ضد التهابی عصبی را فراهم مینماید. همچنین جذب ترکیبات طراحی شده بر روی نانولوله کربنی (0و8) عاملدار با استفاده از شبیهسازی دینامیک مولکولی ومیدان نیرو COMPASS انجام گردید. نتایج جذب مشتقات طراحی شده بر نانولوله کربنی (0و8) عاملدار نشان داد که برهمکنشها میتوانند شامل برهمکنشهای جزئی π–π و پیوندهای هیدروژنی باشند. مطالعه برهمکنش این ترکیبات با نانولوله کربنی (0و8) عاملدار جهت یافتن حاملهای دارویی پایه نانولوله کربنی برای این مشتقات، میتواند مناسب باشد.
